UMR Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques (UMR DSIMB)

Publié le 03/02/2016

 

 

Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques
Statut : Unité Mixte de Recherche qui associe l’Université de La Réunion, l’Université de Paris-Diderot (Paris 7)
et l’INSERM. Implantation principale à La Réunion.


ACTIVITÉS DE RECHERCHE


Thématiques de recherche


Les recherches de l’UMR portent sur les approches bioinformatiques
pour l’étude des structures des protéines et leurs interactions et
applications. Les thèmes sont les suivants :

  • Analyse de la structure des protéines et comparaison en utilisant
    des alphabets structuraux ;
  • Comprendre les mécanismes de reconnaissance moléculaire entre
    les protéines et les ligands en utilisant à la fois les simulations
    de dynamique moléculaire et les calculs de chimie quantique ;
  • Analyse de génomes et applications ;
  • Approches in silico et évolution dirigée des protéines ;
  • Modélisation moléculaire de petites protéines et peptides ;
  • Analyse et modélisation structurale 3D des protéines riches en
    ponts disulfures ;
  • Analyse des données et exploitation appliquée à des données
    biologiques et à des systèmes.


PUBLICATIONS MAJEURES


En moyenne 5 publications annuelles

OFFRE EXPERTISES


  • Expertises dans le secteur des biotechnologies, de la Bioinformatique,
    de l’analyse des données biologiques, modélisation, optimisation


Plateaux techniques et équipements de pointe


  • Calculateur SCIENTIFIQUE : cluster 16 coeurs


COLLABORATION


Nationale

  • INSA, Toulouse, France
  • LE2P, Université de La Réunion, France
  • Laboratoire Enzymologie de complexes supramoléculaires, BIP
    (Bioénergétique et Ingénierie des Protéines), CNRS, Marseille, France


Internationale

  • Indian Institute of Science, National Centre for Biological Sciences,
    Bangalore, Inde
  • Institute of Applied Biotechnology and Bioinformatics, Bangalore, Inde
  • Max Planck Institute for Coal Research, Mulheim an der Ruhr, Allemagne
  • TUFTS University, Boston, MA, USA
  • Stanford University, Palo Alto, CA, USA
  • California Institute of Technology, Pasadena, CA, USA


BREVETS ET LICENCES


Logiciels divers, brevets en cours


Adresse : Université, Faculté des Sciences et Technologies,
15 avenue René Cassin, BP 7151,
97715 Saint-Denis Messagerie CEDEX 09, La Réunion.

Email : fabrice.gardebien@univ-reunion.fr

Site : www.bioinformatics.univ-reunion.fr

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