UMR Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques (UMR DSIMB)
Publié le 03/02/2016
Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques
Statut : Unité Mixte de Recherche qui associe l’Université de La Réunion, l’Université de Paris-Diderot (Paris 7)
et l’INSERM. Implantation principale à La Réunion.
ACTIVITÉS DE RECHERCHE
Thématiques de recherche
Les recherches de l’UMR portent sur les approches bioinformatiques
pour l’étude des structures des protéines et leurs interactions et
applications. Les thèmes sont les suivants :
- Analyse de la structure des protéines et comparaison en utilisant
des alphabets structuraux ; - Comprendre les mécanismes de reconnaissance moléculaire entre
les protéines et les ligands en utilisant à la fois les simulations
de dynamique moléculaire et les calculs de chimie quantique ; - Analyse de génomes et applications ;
- Approches in silico et évolution dirigée des protéines ;
- Modélisation moléculaire de petites protéines et peptides ;
- Analyse et modélisation structurale 3D des protéines riches en
ponts disulfures ; - Analyse des données et exploitation appliquée à des données
biologiques et à des systèmes.
PUBLICATIONS MAJEURES
En moyenne 5 publications annuelles
OFFRE EXPERTISES
- Expertises dans le secteur des biotechnologies, de la Bioinformatique,
de l’analyse des données biologiques, modélisation, optimisation
Plateaux techniques et équipements de pointe
- Calculateur SCIENTIFIQUE : cluster 16 coeurs
COLLABORATION
Nationale
- INSA, Toulouse, France
- LE2P, Université de La Réunion, France
- Laboratoire Enzymologie de complexes supramoléculaires, BIP
(Bioénergétique et Ingénierie des Protéines), CNRS, Marseille, France
Internationale
- Indian Institute of Science, National Centre for Biological Sciences,
Bangalore, Inde - Institute of Applied Biotechnology and Bioinformatics, Bangalore, Inde
- Max Planck Institute for Coal Research, Mulheim an der Ruhr, Allemagne
- TUFTS University, Boston, MA, USA
- Stanford University, Palo Alto, CA, USA
- California Institute of Technology, Pasadena, CA, USA
BREVETS ET LICENCES
Logiciels divers, brevets en cours
Adresse : Université, Faculté des Sciences et Technologies,
15 avenue René Cassin, BP 7151,
97715 Saint-Denis Messagerie CEDEX 09, La Réunion.
Email : fabrice.gardebien@univ-reunion.fr
Site : www.bioinformatics.univ-reunion.fr
(Fonds Européen de Développement Régional)